From: A CpG island hypermethylation profile of primary colorectal carcinomas and colon cancer cell lines
hMLH1 | MGMT | p16 INK4a | p14 ARF | APC | E-cadherin | |||||||||||||
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M | U | M | U | M | U | M | U | M | U | M | U | |||||||
Individuals | ||||||||||||||||||
No | 11/53 | 42/53 | 21/53 | 32/53 | 17/53 | 36/53 | 20/52 | 32/52 | 17/53 | 36/53 | 21/52 | 31/52 | ||||||
Gen. Characteristics | ||||||||||||||||||
Ploidy | ||||||||||||||||||
Diploid | 10 | 20 | 10 | 20 | 10 | 20 | 18 | 12 | 11 | 19 | 13 | 17 | ||||||
Aneuploid | 1 | 22 | 11 | 12 | 7 | 16 | 2 | 20 | 6 | 17 | 8 | 14 | ||||||
P value | 0.02 | NS | NS | < 0.001 | NS | NS | ||||||||||||
MSI-status | ||||||||||||||||||
MSI | 11 | 17 | 11 | 17 | 10 | 18 | 17 | 11 | 10 | 18 | 11 | 17 | ||||||
MSS | 0 | 25 | 10 | 15 | 7 | 18 | 3 | 21 | 7 | 18 | 10 | 14 | ||||||
P value | < 0.001 | NS | NS | 0.001 | NS | NS | ||||||||||||
TP53 | ||||||||||||||||||
Wild type | 11 | 22 | 12 | 21 | 11 | 22 | 16 | 16 | 8 | 25 | 13 | 19 | ||||||
Mutation | 0 | 16 | 7 | 9 | 5 | 11 | 4 | 12 | 7 | 9 | 7 | 9 | ||||||
P value | 0.01 | NS | NS | NS | NS | NS | ||||||||||||
wt+non G-A mutation | 11 | 33 | 15 | 29 | 14 | 30 | 18 | 25 | 13 | 31 | 17 | 26 | ||||||
G-A mutation | 0 | 4 | 3 | 1 | 1 | 3 | 1 | 3 | 1 | 3 | 2 | 2 | ||||||
P value | NS | NS | NS | NS | NS | NS | ||||||||||||
K-Ras | ||||||||||||||||||
Wild type | 8 | 19 | 13 | 14 | 9 | 18 | 12 | 15 | 7 | 20 | 9 | 18 | ||||||
Mutation | 1 | 14 | 6 | 9 | 3 | 12 | 2 | 12 | 6 | 9 | 6 | 8 | ||||||
P value | NS | NS | NS | 0.08 | NS | NS | ||||||||||||
wt+non G-A mutation | 8 | 23 | 15 | 16 | 9 | 22 | 13 | 18 | 8 | 23 | 10 | 21 | ||||||
G-A mutation | 1 | 10 | 4 | 7 | 3 | 8 | 1 | 9 | 5 | 6 | 5 | 5 | ||||||
P value | NS | NS | NS | NS | NS | NS | ||||||||||||
APC | ||||||||||||||||||
Wild type | 7 | 19 | 12 | 14 | 10 | 16 | 9 | 17 | 9 | 17 | 12 | 14 | ||||||
Mutation | 3 | 23 | 8 | 18 | 7 | 19 | 10 | 15 | 8 | 18 | 9 | 16 | ||||||
P value | NS | NS | NS | NS | NS | NS | ||||||||||||
Clin. and Path. Features | ||||||||||||||||||
Sex | ||||||||||||||||||
Male | 2 | 23 | 9 | 16 | 8 | 17 | 6 | 19 | 10 | 15 | 8 | 17 | ||||||
Female | 9 | 19 | 12 | 16 | 9 | 19 | 14 | 13 | 7 | 21 | 13 | 14 | ||||||
P value | 0.04 | NS | NS | 0.05 | NS | NS | ||||||||||||
Age (years) | ||||||||||||||||||
<68 | 2 | 21 | 10 | 13 | 4 | 19 | 7 | 16 | 8 | 15 | 9 | 14 | ||||||
≥68 | 9 | 21 | 11 | 19 | 13 | 17 | 13 | 16 | 9 | 21 | 12 | 17 | ||||||
P value | 0.09 | NS | 0.07 | NS | NS | NS | ||||||||||||
Location | ||||||||||||||||||
Right | 10 | 8 | 7 | 11 | 7 | 11 | 12 | 6 | 7 | 11 | 7 | 11 | ||||||
Left | 1 | 19 | 8 | 12 | 9 | 11 | 5 | 14 | 6 | 14 | 8 | 11 | ||||||
Rectum | 0 | 14 | 6 | 8 | 1 | 13 | 2 | 12 | 4 | 10 | 5 | 9 | ||||||
P value | < 0.001* | NS | 0.05 | 0.01 | NS | NS | ||||||||||||
Histologic grade | ||||||||||||||||||
Poorly differentiated | 4 | 8 | 7 | 5 | 6 | 6 | 7 | 4 | 5 | 7 | 4 | 7 | ||||||
Moderately differentiated | 7 | 30 | 13 | 24 | 11 | 26 | 12 | 25 | 11 | 26 | 14 | 23 | ||||||
Well differentiated | 0 | 3 | 1 | 2 | 0 | 3 | 0 | 3 | 1 | 2 | 2 | 1 | ||||||
P value | NS | NS | NS | NS | NS | NS | ||||||||||||
Dukes' classification | ||||||||||||||||||
A | 2 | 2 | 3 | 1 | 1 | 3 | 2 | 2 | 0 | 4 | 1 | 3 | ||||||
B | 5 | 22 | 10 | 17 | 8 | 19 | 9 | 17 | 13 | 14 | 12 | 14 | ||||||
C | 2 | 13 | 4 | 11 | 4 | 11 | 4 | 11 | 3 | 12 | 5 | 10 | ||||||
D | 2 | 5 | 4 | 3 | 4 | 3 | 5 | 2 | 1 | 6 | 3 | 4 | ||||||
P value | NS | NS | NS | NS | 0.07 | NS |