Skip to main content

Table 1 Methylation status of 19 CpG sites in the 450 bp promoter region of HLA-G gene in malignant (CA), benign (BN) and normal (NL) ovarian tissue samples.

From: Epigenetic changes within the promoter region of the HLA-G gene in ovarian tumors

CA -394 -356 -290 -272 -261 -241 -211 -188 -186 -150 -125 -121 -68 -65 -62 -60 -39 -27 -8
212 0 0 1 1 1 1 1 0.00 0.00 0.25 0.00 0.25 0.75 0.00 0.75 0.00 0.00 0.00 0.75
229 0 0 1 1 1 1 1 0.00 0.00 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00
183 0 0 1 1 1 1 1 0.00 0.00 0.38 0.00 0.38 0.63 0.00 0.63 0.00 0.00 0.00 0.63
317 0 0 1 1 1 1 1 0.60 0.60 0.80 0.00 0.80 0.20 0.20 0.80 0.00 0.60 0.00 0.40
369 0 0 1 1 1 1 1 0.40 0.40 0.60 0.20 0.60 0.40 0.00 1.00 0.20 0.60 0.00 0.20
413 0 0 1 1 1 1 1 0.60 0.60 1.00 0.00 0.80 0.00 0.00 0.80 0.00 0.60 0.00 0.20
170 0 0 1 1 1 1 1 0.20 0.20 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.20 0.00 0.00
228 0 0 1 1 1 1 1 0.75 0.75 0.75 0.00 0.75 0.25 0.25 1.00 0.00 0.75 0.00 0.25
242 0 0 1 1 1 1 1 0.20 0.20 0.40 0.00 0.40 0.60 0.00 0.80 0.00 0.20 0.00 0.80
AVE 0.000 0.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.306 0.306 0.687 0.022 0.664 0.314 0.050 0.664 0.022 0.328 0.000 0.359
BN                    
382 0 0 1 1 1 1 1 0.00 0.00 0.40 0.00 0.40 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00 0.00 0.80
412 0 0 1 1 1 1 1 0.60 0.80 0.80 0.00 0.80 0.20 0.00 0.83 0.00 0.60 0.00 0.00
388 0 0 1 1 1 1 1 0.17 0.17 0.17 0.00 0.17 0.67 0.00 1.00 0.00 0.33 0.00 0.83
416 0.20 0 1 1 1 1 1 0.40 0.40 0.60 0.00 0.60 0.40 0.00 0.80 0.00 0.40 0.00 0.60
371 0.14 0 1 1 1 1 1 0.14 0.14 0.43 0.00 0.43 0.57 0.00 0.71 0.00 0.29 0.00 0.71
377 0.20 0.20 0.60 1 1 1 1 0.40 0.60 0.60 0.20 0.60 0.20 0.00 0.60 0.00 0.60 0.00 0.00
386 0.20 0 1 1 1 1 1 0.00 0.00 0.60 0.00 0.60 0.40 0.00 0.40 0.00 0.00 0.00 0.40
400 0 0 1 1 1 1 1 0.20 0.50 0.50 0.00 0.50 0.50 0.00 1.00 0.00 0.50 0.00 0.50
383 0 0 1 1 1 1 1 0.10 0.10 0.90 0.00 0.90 0.10 0.00 0.30 0.00 0.10 0.00 0.13
AVE 0.082 0.022 0.956 1.000 1.000 1.000 1.000 0.223 0.301 0.556 0.022 0.556 0.404 0.000 0.694 0.000 0.313 0.000 0.441
NL                    
492 0.40 0.40 0.40 0.60 0.80 1.00 0.80 0.00 0.20 0.20 0.20 0.20 0.40 1.00 0.20 0.20 0.00 0.00 0.20
499 0.17 0.33 0.50 0.67 0.83 0.67 0.83 0.50 0.00 0.33 0.50 0.50 0.50 0.50 0.67 0.17 0.00 0.00 0.17
500 0.60 0.80 0.00 0.80 0.40 0.80 0.80 0.00 0.00 0.20 0.20 0.20 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 0.00 0.00
525 0.33 0.33 0.00 1.00 1.00 1.00 0.67 0.00 0.00 0.00 0.33 0.33 0.33 0.33 0.67 0.00 0.00 0.33 0.33
AVE 0.374 0.466 0.225 0.767 0.758 0.867 0.776 0.125 0.050 0.183 0.308 0.308 0.308 0.458 0.384 0.092 0.050 0.083 0.174
P-VALUES                    
CA VS NL <1E-04 <1E-04 <1E-04 0.001 0.011 0.025 <1E-04 0.308 0.122 0.008 0.0004 0.033 0.970 0.014 0.225 0.174 0.111 0.139 0.277
BN VS NL 0.003 0.0002 <1E-04 0.001 0.011 0.025 <1E-04 0.466 0.121 0.010 0.0004 0.063 0.448 0.005 0.087 0.019 0.059 0.139 0.153
  1. Values shown for each sample/position are the average of 5–8 clones. Significance of differences at each CpG site between tumor and normal samples are shown.