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Table 3 Overlapping of H-JNK1 signature genes with other types of HCCs

From: JNK1 activation predicts the prognostic outcome of the human hepatocellular carcinoma

Up in

H-JNK/L-JNK

HB

HCC §

Up In HB**

mTOR

HCC ¶

EpCAM

HCC †

Down in

H-JNK1/L-JNK1

HB

HCC

Down

In HB

mTOR

HCC

EpCAM

HCC

Genes

Fold

 

rC2/rC1*

  

Genes

Fold

 

rC2/rC1

  

S100P

611

   

Y

CYP2D6

-112

Y

0.1

 

Y

S100A8

371

Y

a

 

Y

GYS2

-122

 

0.1

Y

Y

AGR2

309

    

F9

-141

 

0.1

 

Y

S100A9

278

 

a

 

Y

CFHR5

-148

   

Y

CCL20

266

  

Y

Y

NAT2

-151

 

0.2

 

Y

PEG10

206

 

14.9

 

Y

ADH1B

-151

 

0.1

  

CD24

163

 

6.7

Y

Y

SPP2

-154

 

a

  

NTS

143

Y

  

Y

LECT2

-155

Y

 

Y

 

SPP1

126

   

Y

SLC22A1

-156

Y

0.1

 

Y

PLAC8

121

 

a

 

Y

SLC27A5

-156

 

0.2

 

Y

H19

92

 

qPCR

 

Y

BAAT

-173

  

Y

Y

SPINK1

78

   

Y

FMO3

-183

Y

0.1

Y

Y

GALNT7

63

   

Y

RTP3

-217

   

Y

HMGA2

61

 

5.5

 

Y

ACSM2B

-222

   

Y

C1orf106

61

   

Y

CYP8B1

-224

Y

 

Y

Y

AMIGO2

55

   

Y

AFM

-239

 

a

Y

 

AFP

54

 

35

 

Y

CYP2C9

-242

Y

0.2

Y

 

XIST

52

    

CYP2E1

-244

Y

0.2

Y

 

UBE2C

51

   

Y

PCK1

-251

Y

0.1

 

Y

NEBL

49

    

OTC

-276

Y

  

Y

SOX4

48

 

3.0

 

Y

HSD17B6

-298

 

0.1

 

Y

IER3

45

Y

  

Y

GLYAT

-458

Y

0.2

Y

Y

EGLN3

42

    

CYP2C8

-525

 

0.0

 

Y

TMED3

40

   

Y

ADH4

-535

  

Y

 

PRKAR2B

40

   

Y

AQP9

-684

Y

0.2

Y

Y

IGFBP3

39

   

Y

SERPINC1

-711

Y

a

 

Y

S100A4

39

   

Y

SLC10A1

-975

 

0.1

 

Y

BASP1

38

 

b

  

HSD11B1

-1040

 

0.1

Y

Y

CXCL13

37

    

CYP3A4

-1458

Y

   

KRT19

34

Y

10.5

 

Y

HPD

-1864

Y

0.2

Y

 
  1. A: Up or down in later stage HB; b: Up or down in early stage HB; *: ratio of rC2/rC1; Y: covered by the indicated studies; §HB HCC, ref.[22]; **HB: ref. [16]; ¶mTOR HCC: ref. [11]; †EpCAM HCC: ref. [12].
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Molecular Cancer

ISSN: 1476-4598