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Table 2 Identified proteins within the protein spots showing at least two-fold up- or down-regulation between the cell lines of the malignant transformation model.

From: Malignant transformation in a defined genetic background: proteome changes displayed by 2D-PAGE

Spot No

SwissProt ID

gene

BJ

T

TE

TER

IPI ID

1

P04792

HSPB1

1,00

0,69

0,17

0,13

 
 

Q13242

SFRS9

     

2

P30041

PRDX6

1,00

0,25

0,00

0,00

 

3

Q06323

PSME1

1,00

0,98

1,03

2,05

 
 

P35232

PHB

     

4

Q9UNF0

PACSIN2

1,00

1,10

0,40

0,34

 

5

P43487

RANBP1

1,00

0,79

2,18

2,61

 
 

P25788

PSMA3

     
 

P07686

HEXB

     

6

Q15691

MAPRE1

1,00

1,03

2,46

1,69

 
 

Q99426

TBCB

     
 

P61247

RPS3A

     

7

N.D.

 

1,00

1,99

5,53

5,98

 

8

P12004

PCNA

1,00

1,10

2,59

2,97

 
 

P01584

IL1B

     

9

N.D.

 

1,00

0,88

0,27

0,20

 

10

N.D.

 

1,00

0,76

0,21

0,16

 

11

O00463

TRAF5

1,00

0,71

0,30

0,16

 

12

P13716

ALAD

1,00

0,72

0,48

0,44

 
 

O14656

TOR1A

     

13

P07355

ANXA2

1,00

2,58

0,00

0,00

 

14

P31942

HNRPH3

1,00

0,99

0,29

0,18

 
 

P02545

LMNA

     

15

N.D.

 

1,00

0,62

0,39

0,40

 

16

N.D.

 

1,00

0,95

0,41

0,34

 

17

O60664

M6PRBP1

1,00

2,30

3,26

2,40

 
 

P06748

NPM1

     
 

P07195

LDHB

     

18

P08670

VIM

1,00

1,03

0,33

0,23

 

19

Q9UJZ1

STOML2

1,00

1,24

2,46

2,81

 
 

Q9NWT6

HIF1AN

     
 

O94905

ERLIN2

     

20

P05120

SERPINB2

1,00

2,18

1,84

1,50

 
 

P60709

ACTB

     

21

P60709

ACTB

1,00

1,09

0,53

0,38

 

22

P60709

ACTB

1,00

1,80

0,00

0,39

 
 

Q12905

ILF2

     
 

P60842

EIF4A1

     
 

O60664

M6PRBP1

     

23

N.D.

 

1,00

2,14

0,42

0,36

 

24

Q9Y570

PPME1

0

0

235347

119221

 
 

Q6NUK1

SLC25A24

    

IPI00337494

25

Q9Y570

PPME1

1,00

0,79

0,20

0,16

 
 

Q13148

TARDBP

     
 

P60709

ACTB

     

26

P23526

AHCY

1,00

0,85

0,40

0,33

 
 

P36507

MAP2K2

     
 

none

none

    

IPI00410404

 

Q6NUK1

SLC25A24

    

IPI00337494

27

P06733

ENO1

1,00

1,07

0,57

0,00

 
 

P68104

EEF1A1

     

28

P09913

IFIT2

1,00

0,79

0,06

0,08

 
 

P00352

ALDH1A1

     
 

Q15813

TBCE

     
 

P12268

IMPDH2

     
 

O43175

PHGDH

     
 

P11413

G6PD

     

29

P00352

ALDH1A1

1,00

0,71

0,00

0,00

 
 

O43175

PHGDH

     
 

Q9UMS4

PRPF19

     

30

P11413

G6PD

1,00

0,74

0,00

0,00

 
 

P28838

LAP3

     

31

N.D.

 

1,00

0,49

0,23

0,00

 

32

Q12931

TRAP1

1,00

1,36

3,16

2,15

 

33

P06396

GSN

1,00

0,88

0,36

0,48

 
 

Q96TA1

FAM129B

     

34

P20591

MX1

1,00

1,78

1,59

2,10

 
 

P13667

PDIA4

     
 

P11021

HSPA5

     
 

P17812

CTPS

     

35

P08238

HSP90AB1

1,00

0,99

0,97

2,07

 
 

P07900

HSP90AA1

     

36

P30048

PRDX3

1,00

0,94

1,86

2,07

 
 

P62491

RAB11A

     
 

P27635

RPL10

     

37

P10809

HSPD1

1,00

1,10

1,79

2,09

 
 

P68363

K-ALPHA-1

     
 

P07237

P4HB

     
 

P60709

ACTB

     
 

P54578

USP14

     
 

P48643

CCT5

     

38

P08729

KRT7

1,00

0,96

0,00

0,00

 

39

Q969P6

TOP1MT

1,00

0,85

0,43

0,38

 
 

P08670

VIM

     
 

P14625

HSP90B1

     
  1. Shown are the corresponding SwissProt ID, gene name and the average regulation of the protein spot normalized to the spot intensity in the BJ cells (bold = up-regulation, bold italic = down-regulation). For detailed information see Additional file 1.