From: Pathway-specific differences between tumor cell lines and normal and tumor tissue cells
Breast | CNS | Colon | Ovary | Prostate | Renal | ||||||
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UP | DOWN | UP | DOWN | UP | DOWN | UP | DOWN | UP | DOWN | UP | DOWN |
GALNS | APP | ACTB | ATP5O | ARD1A | ADH1B | MCM2 | ACTG2 | Â | APOD | Â | ADH1B |
GP9 | AQP1 | CPSF1 | COX7A1 | ARPC1B | BRD2 | Â | AEBP1 | Â | CCND2 | Â | ALDH4A1 |
LCAT | ARHGEF6 | DDX11 | CTNNB1 | BCAT1 | C7 | Â | C7 | Â | CXCL12 | Â | ANPEP |
RND2 | ATP6V1B2 | ECE1 | GYPE | CCND1 | CA2 | Â | CEBPD | Â | KCNMB1 | Â | ASS |
 | BRD2 | EEF1A1 | ITGB7 | CPNE1 | CALCOCO2 |  | CNN1 |  | MATN2 |  | ATP6V1B1 |
 | CTNNB1 | EEF1G | KIAA0513 | CUL7 | CASC3 |  | DPYSL2 |  | PTGDS |  | C7 |
 | CXCL12 | FRAP1 | MEF2C | ERCC1 | CES2 |  | DUSP1 |  | PTN |  | CLCNKB |
 | DUSP1 | GNAI2 | MRPS21 | GPS1 | CHGA |  | EGR1 |  | SERPING1 |  | ENG |
 | EGR1 | GNB1 | MYOM2 | MDK | CLEC3B |  | FOS |  | SPARCL1 |  | EPHX2 |
 | EGR3 | GNB2 | PCP4 | PDXK | CNN1 |  | GYPC |  |  |  | FABP1 |
 | IGFBP4 | GPIAP1 | PVALB | PEX6 | CRYAB |  | IGFBP5 |  |  |  | GATA3 |
 | JUND | GPS1 | S100A1 | PHLDA2 | CTNNB1 |  | JUNB |  |  |  | GATM |
 | KHSRP | H3F3B | SEPP1 | S100A11 | CUGBP2 |  | LMOD1 |  |  |  | GPX3 |
 | KIT | HNRPF | SERPINI1 | TEAD4 | DMD |  | LUM |  |  |  | GSTA2 |
 | KRT15 | KHDRBS1 |  |  | DPYSL2 |  | MYH11 |  |  |  | HMGCS2 |
 | KRT5 | MAZ |  |  | FABP4 |  | MYLK |  |  |  | HPD |
 | MXI1 | NONO |  |  | FCGBP |  | NDN |  |  |  | KCNJ1 |
 | MYH11 | ODC1 |  |  | FGFR2 |  | NR4A1 |  |  |  | MT1G |
 | NFIB | PCBP2 |  |  | FHL1 |  | PPAP2B |  |  |  | MT1X |
 | NSMAF | RAB7 |  |  | GDI1 |  | SEPP1 |  |  |  | PAH |
 | PCBP1 | RBM10 |  |  | GPD1L |  | SERPINF1 |  |  |  | PALM |
 | SERPINA3 | RBM5 |  |  | HMGCS2 |  | SPARCL1 |  |  |  | PCK2 |
 | SNTB2 | RHOB |  |  | HSD11B2 |  | TNXB |  |  |  | PRODH2 |
 | SOX9 | SMARCA4 |  |  | HSPA1A |  | ZBTB16 |  |  |  | PTHR1 |
 | SPARCL1 | SRM |  |  | IL11RA |  | ZFP36 |  |  |  | SERPINA5 |
 | VWF | TRIM28 |  |  | IL6R |  |  |  |  |  | TACSTD1 |
 | ZFP36 | TUBB |  |  | ITGA7 |  |  |  |  |  | UGT2B7 |
 |  | UFM1 |  |  | ITPKB |  |  |  |  |  | UMOD |
 |  | YBX1 |  |  | LMOD1 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | LPL |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | MAOA |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | NFIB |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | NR3C2 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | PCK1 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | PLN |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | PPAP2B |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | PPP1R1A |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | PRKCB1 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | SEPP1 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | SLC26A3 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | SMTN |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | SPIB |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | SRPX |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | TACR2 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | TGFBR3 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | TPM1 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | TPM2 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | TSPAN7 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | TUBA3 |  |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | ZBTB16 |  |  |  |  |  |  |